Истоки сегодняшнего Музея естествознания Лодзинского университета датируются 1930 годом, когда на базе коллекций существовавших в то время в Лодзи учреждений - Музея науки и искусства и Центральной городской мастерской естествознания и педагогики - был основан Музей естествознания и педагогики. Организатором довоенного музея и его первым директором был Эдвард Потенга, а штаб-квартирой музея стало здание бывшей закусочной, расположенное в парке им. Сенкевича в Лодзи на улице Kilińskiego. В этом же здании Музей естествознания находится до настоящего времени.
В межвоенный период музей в основном занимался просветительской деятельностью для нужд лодзинского образования, а также являлся резиденцией нескольких лодзинских журналов о естествознании. Во время Второй мировой войны руководителем музея был немец Эрнст Кеппен, который собрал большую коллекцию позвоночных Лодзинского региона. В 1945–1950 гг. музей оставался самостоятельным образовательным учреждением. В 1952 году он был преобразован в филиал Института зоологии Польской академии наук, а затем, в 1962 году, включен в состав Лодзинского университета как часть существовавшей тогда кафедры эволюционизма.
Сегодняшний Музей естествознания входит в структуру факультета Биологии и охраны окружающей среды Лодзинского университета на кафедре Экспериментальной зоологии и эволюционной биологии. В течение всех лет существования музея интенсивно приобретались новые экспонаты и коллекции. Часть современной коллекции имеет историческую ценность и датируется довоенным периодом. В коллекции музея находятся образцы, редко встречающиеся в польских музеях естествознания. Количество всех экспонатов оценивается в более чем 100 000, причем наиболее многочисленной группой являются насекомые.
В настоящее время завершены комплексная перестройка и модернизация музея, благодаря которым был создан культурно-образовательный центр, где представлены современные выставки на темы, связанные с естествознанием. Значительное увеличение выставочной и складской площадей (всего около 800 м2) позволило создать новые экспозиции и улучшить условия хранения и консервации коллекций.
